In Waterwerk wordt de geschiedenis van de maritieme sector van Nederland getoond. Nederland heeft een lange geschiedenis in zeescheepvaart, de scheepsbouw, de havens, de binnenvaart en de visserij. Later zijn daar waterbouw, offshore, watersport, de Koninklijke Marine en maritieme toeleveranciers bijgekomen. Het magazine Waterwerk toont in elk seizoen een ander thema, zoals werk en loopbaan, opleiding en scholing en geschiedenis. Per aflevering worden 3 à 4 onderwerpen uitgelicht.

De serie waterwerk heeft in totaal 3 seizoenen gelopen, met 9 afleveringen per seizoen. Waterwerk is gemaakt in samenwerking met de Stichting Nederland Maritiem Land.